香港男人在深圳建立家庭，在香港工作，天天“冲关”，奔走中港两地，面对工作及生活，这是每一个香港人及内地同胞所热衷话题，【爸爸两边走】选择了这题材为主轴，剧情以温情伦理为主导，故事以写实手段描述香港及内地人对婚姻及情感的意见，回归之后香港及中国之间生活变迁为重点，以亲情及爱情为原素。并以崭新手段，以国内全实景拍摄作包装，赐与观众清新写实的感到。演员阵容鼎盛，包含：林韦辰、万绮雯、张文慈、袁文杰、江美仪、吴廷烨、楼南光、吕有慧、谢雪心、杜挺豪等，全情投演，反影社会实况。
　　任职男护事的曾耀乾，带着儿子曾诚到机场老婆接机，无意中发现了老婆方泗曼原来与上司杨永祥有奸情，耀乾曾经想挽救这段婚姻危机，无奈老婆将婚姻及事业挂了勾…结婚七年，老婆由一个护士晋升至行政经理，而耀乾还逗留在男关照阶段，夫妻的距离由近而远，逐渐同床异梦。耀乾知道无法挽救这段婚姻，欲与老婆离婚，老婆感到对家庭仍有义务，不肯离异，耀乾为了让老婆死心，带着儿子离去，回到深圳暂住。
　　耀乾一边在香港工作，一边要回到深圳照顾儿子，开始了爸爸两边走的生活，耀乾天天“冲关”时发觉，原来有很多香港人也是跟他一般的遭遇，每日奔走中港两地，面对工作及生活。当耀乾逐渐顺应了中港两边走的生活后，开始在国内熟悉了不少朋友，其中一个是弱视的钢琴教师常萍，常萍虽然弱视，但人却倔强，对生命充斥寄望，不只不需要人照顾，还能反过来照顾耀乾及曾诚…日久生情，耀乾与常萍渐成爱侣。
　　常萍有一个愿望，希望能参加全国音乐竞赛，惋惜身体残疾使她不能如愿，耀乾想尽法子帮助常萍治好了她的眼疾，使常萍能够如愿，在数万人面前表演钢琴，常萍喜极而泣…而耀乾也在帮助常萍的过程里，在失败婚姻阴影中爬起来，从新做人。当耀乾及常萍情感成熟，预备结婚之时，却遇到最大的考验…泗曼与永祥的情感告终，想吃回头草，就算不能得回耀乾的爱，也要得回儿子曾诚…最后耀乾面对情义的抉择，作出了一个肯定的抉择…继续爸爸两边走的生活。